Longevity & AgingNuova mappa spaziale rivela dove si trovano i marcatori m6A dell'RNA all'interno di tessuti intatti di topo
L'RNA porta con sé "etichette" chimiche, e una delle più comuni, la N6-metiladenosina (m6A), contribuisce a controllare il modo in cui i geni vengono utilizzati. Finora i ricercatori riuscivano raramente a vedere dove si trovi la m6A all'interno di un tessuto intatto. Questo studio presenta m6A-ARTR-DBiT, un metodo che combina il rilevamento della m6A basato sulla trascrizione inversa con il barcoding spaziale in situ per mappare la m6A nell'intero trascrittoma, mantenendo intatta l'architettura del tessuto. Gli autori lo hanno applicato a tessuti embrionali di topo e a cervelli adulti, individuando pattern di m6A specifici per regione tra i diversi domini funzionali. I livelli di m6A hanno mostrato una correlazione positiva con l'espressione degli enzimi "writer" della m6A (metiltransferasi) e delle proteine leganti, il che ha aiutato a identificare una regolazione epitranscrittomica specifica per regione tissutale. Nell'ippocampo, il metodo ha permesso di risolvere l'organizzazione della m6A all'interno di strutture a scala fine. Il lavoro rappresenta un progresso nello sviluppo di strumenti, condotto sul topo, e non uno studio clinico, ma apre la strada allo studio delle modificazioni dell'RNA nello sviluppo, nella funzione cerebrale e nelle malattie legate all'invecchiamento.
