Longevity & AgingUn catalogo quasi completo dei genomi intestinali provenienti da 41 paesi affina i modelli del metabolismo microbico
Un gruppo di ricercatori ha sviluppato HRGM2, una versione ampliata della risorsa Human Reference Gut Microbiome che contiene 155.211 genomi non ridondanti e quasi completi, appartenenti a 4.824 specie di procarioti provenienti da 41 paesi. Ogni genoma rispetta soglie di qualità rigorose (completezza di almeno il 90% e contaminazione non superiore al 5%). Si tratta di un aumento del 66% dei genomi e del 50% delle specie rispetto al catalogo Unified Human Gastrointestinal Genome. Secondo gli autori, la risorsa migliora la profilazione delle specie basata sul DNA, aiuta a risolvere le differenze a livello di ceppo e supporta le indagini sui geni di resistenza agli antibiotici nell'intestino. L'impiego di soli genomi di alta qualità ha inoltre consentito di costruire modelli metabolici automatizzati su scala genomica di intere comunità intestinali, che secondo gli autori rivelano interazioni metaboliche tra microbi associate a malattie. Il lavoro è uno strumento fondamentale per la scienza del microbiota, non uno studio clinico, ma potrebbe rendere più affidabili le future ricerche sulla salute intestinale e sull'invecchiamento.
