Longevity & AgingLo Strumento AI DeepScence Mappa le Cellule Senescenti con Precisione Senza Precedenti
I ricercatori della Duke University hanno sviluppato DeepScence, uno strumento di deep learning non supervisionato basato su un'architettura autoencoder, per rilevare le cellule senescenti nei dati di sequenziamento dell'RNA a singola cellula e di trascrittomica spaziale. Il team ha innanzitutto creato CoreScence, un insieme di geni curato composto da 39 geni riportati in modo consistente in almeno cinque database pubblicati di geni della senescenza, affrontando così la marcata discordanza tra gli insiemi di geni esistenti. DeepScence utilizza CoreScence come input e apprende pattern di espressione genica complessi e non lineari per assegnare a ciascuna cellula un punteggio lungo un continuum di senescenza. Testato su dataset in vitro e in vivo provenienti da più piattaforme, DeepScence ha superato in modo sostanziale i metodi di scoring esistenti e lo strumento supervisionato basato su SVM SenCID, raggiungendo valori di AUROC superiori a 0,9 su tutti i dataset e generalizzando efficacemente tra specie, tessuti e contesti di induzione della senescenza.
