Longevity & Aging

L'enzyme bactérienne ApaH décape les signaux d'ARN de stress via deux orientations de liaison

Des scientifiques ont cartographié le mécanisme moléculaire précis par lequel l'enzyme bactérienne ApaH retire les coiffes « alarmone » des molécules d'RNA. Ces coiffes Np4 s'accumulent sur les transcrits bactériens lors d'un stress et influencent l'expression des gènes ainsi que l'espérance de vie des RNA. En combinant la cristallographie aux rayons X, des tests biochimiques et des simulations de dynamique moléculaire, l'équipe a montré que ApaH peut lier son substrat selon deux orientations alternatives, grâce à une combinaison de reconnaissance non spécifique et semi-spécifique. Malgré cette flexibilité, l'enzyme décoiffe efficacement divers types d'RNA. Fait crucial : la capacité de l'enzyme à accommoder les substrats dans deux orientations signifie que des inhibiteurs conçus pour imiter le substrat dans une orientation pourraient être contournés lorsque le substrat se retourne — une considération déterminante pour la conception d'antibiotiques ciblant ApaH.