Des virus dangereux transmis par les tiques se propagent en Pologne, selon une nouvelle étude de surveillance

Les virus transmis par les tiques représentent une préoccupation croissante de santé publique en Europe, la modification du climat, les changements d'utilisation des terres et l'expansion des populations de tiques facilitant leur propagation. Si le virus de la fièvre hémorragique de Crimée-Congo et le virus de l'encéphalite à tiques ont fait l'objet d'une attention soutenue, toute une série de virus moins connus mais potentiellement pathogènes, originaires d'Asie, apparaissent désormais en Europe de l'Est — souvent non détectés en raison de l'absence de diagnostics standardisés.

Cette étude menée en Pologne a utilisé l'amplification par amorce unique indépendante de la séquence (SISPA) combinée au séquençage métagénomique — une approche puissante qui enrichit les acides nucléiques viraux à partir d'échantillons biologiques complexes, sans nécessiter de connaissance préalable du pathogène cible. Les chercheurs ont traité 575 tiques collectées sur le terrain (<em>Dermacentor reticulatus</em> et <em>Ixodes ricinus</em>) provenant de plusieurs sites polonais, regroupées en 20 pools.

L'effort de séquençage a généré 280 assemblages viraux représentant 28 espèces ou souches de virus appartenant à 12 familles taxonomiques. Fait notable, quatre pathogènes humains reconnus ont été identifiés dans 55 % des pools, représentant 19,2 % du total des assemblages. Le virus Alongshan (ALSV), membre du groupe des jingmenvirus associé à des maladies fébriles chez l'humain, a été détecté dans des tiques <em>I. ricinus</em> avec des segments génomiques complets ou quasi complets — marquant la première détection confirmée d'ALSV en Pologne. L'analyse phylogénomique a montré que ces souches polonaises d'ALSV se regroupaient avec d'autres séquences européennes, sans aucune preuve de recombinaison. Le virus Tacheng tick virus 1 (TcTV-1) a été retrouvé dans 35 % des pools provenant des deux espèces de tiques, représentant la première association documentée de TcTV-1 avec <em>I. ricinus</em> à l'échelle mondiale. Le virus Tacheng tick virus 2 (TcTV-2) et le virus Nuomin (NUMV), ou un chuvirus étroitement apparenté, ont également été identifiés dans <em>I. ricinus</em>, les analyses phylogénétiques par maximum de vraisemblance suggérant une ségrégation géographique des clades viraux à travers l'Europe.

Les implications sont significatives : ces virus, précédemment documentés principalement dans des populations de tiques asiatiques, sont désormais manifestement actifs en Europe centrale et orientale. Leur détection chez <em>I. ricinus</em> — une tique très répandue et largement distribuée, et la plus commune à piquer l'humain en Europe — accroît la probabilité d'une exposition humaine et de maladies potentiellement non reconnues. L'absence d'outils diagnostiques sérologiques et moléculaires validés pour ces agents signifie que les infections peuvent être systématiquement manquées dans les contextes cliniques et de surveillance.

Parmi les limites importantes, on relèvera la nature transversale et groupée de l'échantillonnage, qui restreint la capacité à déterminer des taux d'infection précis par tique individuelle ou à évaluer la dynamique de transmission dans le temps. La portée en santé publique d'ALSV, TcTV-1, TcTV-2 et NUMV au sein des populations humaines européennes reste incomplètement définie, et des études cliniques et épidémiologiques complémentaires sont nécessaires.