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L'Anatolie abrite une diversité surprenante de virus transmis par les tiques, menaçant la santé humaine et animale

Une enquête One Health menée dans l'ensemble des 7 régions anatoliennes a mis en évidence cinq virus distincts transmis par les tiques, dont un nouveau nairovirus, chez 11 espèces de tiques.

dimanche 19 juillet 2026 3 vues
Publié dans Parasit Vectors
Close-up of a tick attached to animal skin with colorful viral particle models floating nearby, set against an Anatolian landscape.

Résumé

Des chercheurs ont analysé plus de 1 265 tiques appartenant à 11 espèces, ainsi que 93 échantillons de plasma animal provenant de 20 provinces turques, révélant une remarquable diversité de virus transmis par les tiques. Le virus de la fièvre hémorragique de Crimée-Congo (CCHFV) a été détecté dans cinq espèces de tiques réparties en trois lignées génétiques distinctes. Le virus Tacheng tick virus 1 (TcTV-1) est apparu dans six espèces de tiques ainsi que dans le sang de bovins, ce qui suggère que ces derniers pourraient constituer des réservoirs potentiels. Le virus Jingmen tick virus (JMTV) a formé un nouveau clade phylogénétique plus proche des souches asiatiques que des variants locaux précédemment connus. Le virus Tamdy (TAMV) a été détecté dans deux espèces, et un nairovirus entièrement nouveau a été identifié chez des tiques Haemaphysalis parva, représentant une lignée évolutive distincte ancestrale au TcTV-1, au TAMV et aux nairoviruses associés aux pangolins.

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Résumé détaillé

Les maladies virales transmises par les tiques constituent des menaces mondiales émergentes, façonnées par le changement climatique, les modifications des habitats et les voyages intercontinentaux. L'Anatolie — carrefour entre l'Asie, l'Europe et le Moyen-Orient — se trouve à un point de convergence critique sur les principales routes migratoires des oiseaux, créant des conditions idéales pour l'introduction et la propagation de pathogènes transmis par les tiques. Bien que le CCHFV soit reconnu comme une menace endémique depuis 2002, le panorama plus large des virus transmis par les tiques dans cette région demeurait mal caractérisé.

Cette étude transversale « One Health » a collecté des tiques fixées sur leurs hôtes ainsi que le plasma correspondant provenant de bovins, de moutons, de chèvres, de chiens et de tortues dans les sept régions géographiques d'Anatolie au cours des années 2023–2024. Au total, 1 265 tiques appartenant à 11 espèces ont été traitées en 192 pools, accompagnées de 93 échantillons de plasma animal. Les échantillons ont été criblés à l'aide d'une PCR générique ciblant les nairovirus ainsi que de tests espèce-spécifiques visant le CCHFV, le JMTV, le TcTV-1, le TcTV-2 et le TAMV, les résultats positifs étant confirmés par séquençage et analyse phylogénétique.

Le CCHFV a été détecté dans 10 pools (5,2 %) répartis sur cinq espèces de tiques, avec des séquences couvrant trois lignées connues : Europe 1, Europe 2 et Afrique 1 — un niveau de diversité jusqu'alors jamais documenté simultanément en Anatolie. Le TcTV-1, un nairovirus initialement décrit en Chine et récemment détecté en Europe, a été identifié dans 12 pools (6,3 %) sur six espèces de tiques et, fait capital, dans un échantillon de plasma bovin — fournissant ainsi la première preuve d'un réservoir vertébré potentiel pour le TcTV-1 dans la région. Le JMTV a été retrouvé dans sept pools (3,6 %), avec des séquences formant un nouveau clade phylogénétique plus étroitement apparenté aux souches asiatiques qu'aux isolats anatoliens précédemment rapportés, ce qui suggère des événements d'introduction récents. Le TAMV, un agent apparenté aux phlebovirus, a été détecté dans deux espèces de tiques avec une prévalence poolée de 1 %.

Le résultat le plus frappant est la découverte d'un nouveau nairovirus très divergent dans quatre pools (2 %), exclusivement à partir de tiques <em>Haemaphysalis parva</em>. L'analyse phylogénétique a placé ce virus dans un groupe distinct, ancestralement apparenté au TcTV-1, au TAMV et aux nairovirus associés aux pangolins et aux tiques, suggérant qu'il représente une espèce virale entièrement nouvelle. Son potentiel pathogène pour l'homme ou les animaux demeure inconnu.

Ces résultats soulignent le rôle de l'Anatolie en tant que point chaud de la diversité des virus transmis par les tiques et en tant que corridor probable pour la circulation virale entre l'Asie et l'Europe. L'identification des bovins comme réservoirs putatifs du TcTV-1 présente d'importantes implications pour la biosécurité agricole et le risque de débordement zoonotique. Les cliniciens de la région devraient envisager le CCHFV, le TcTV-1, le JMTV et le TAMV dans le diagnostic différentiel de tout syndrome fébrile survenant après une exposition aux tiques, et les programmes de surveillance devraient être élargis en conséquence.

Principales conclusions

  • CCHFV detected in 5 tick species across 3 distinct genetic lineages (Europe 1, Europe 2, Africa 1) simultaneously in Anatolia.
  • TcTV-1 found in 6 tick species and cattle plasma, suggesting cattle may be a vertebrate reservoir.
  • JMTV sequences formed a new phylogenetic clade more related to Asian strains than local Anatolian isolates.
  • A novel, highly divergent nairovirus was discovered exclusively in Haemaphysalis parva ticks, forming its own evolutionary lineage.
  • TAMV detected in two tick species, expanding known geographic range of this emerging pathogen.

Méthodologie

Enquête de terrain transversale (2023–2024) ayant collecté des tiques fixées sur l'hôte à partir de 5 espèces hôtes et du plasma de bétail dans 20 provinces couvrant les 7 régions géographiques anatoliennes. Les tiques ont été identifiées morphologiquement, regroupées en pools par espèce/sexe/site, puis soumises à un criblage par PCR générique des nairovirus ainsi que par quatre PCR nichées ou simplex espèce-spécifiques, les échantillons positifs étant confirmés par séquençage Sanger et phylogénétique par maximum de vraisemblance.

Limites de l'étude

Le dépistage par PCR sur pools ne permet pas de déterminer les taux d'infection individuels des tiques ni d'estimer une prévalence précise. Seul un nombre limité d'échantillons de plasma animal (93) a été analysé, ce qui restreint les conclusions concernant les réservoirs. Le nouveau nairovirus n'a pas été isolé ni entièrement séquencé, de sorte que son potentiel pathogène et son identité génomique complète demeurent inconnus.

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