Longevity & AgingBakterielles Enzym ApaH decappt RNA-Stresssignale durch zwei Bindungsorientierungen
Wissenschaftler haben den präzisen molekularen Mechanismus kartiert, durch den das bakterielle Enzym ApaH „Alarmon"-Kappen von RNA-Molekülen entfernt. Diese Np4-Kappen akkumulieren während Stressbedingungen auf bakteriellen Transkripten und beeinflussen die Genexpression sowie die Lebensdauer von RNA. Mithilfe von Röntgenkristallographie, biochemischen Assays und molekulardynamischen Simulationen zeigte das Team, dass ApaH sein Substrat aufgrund einer Kombination aus unspezifischer und semispezifischer Erkennung in zwei alternativen Orientierungen binden kann. Trotz dieser Flexibilität dekappiert das Enzym effizient verschiedene RNA-Typen. Entscheidend ist, dass die Fähigkeit des Enzyms, Substrate in zwei Orientierungen aufzunehmen, bedeutet, dass Inhibitoren, die darauf ausgelegt sind, das Substrat in einer Orientierung nachzuahmen, umgangen werden können, wenn das Substrat seine Ausrichtung wechselt – ein wesentlicher Aspekt für das Design von Antibiotika, die auf ApaH abzielen.
