Longevity & AgingLe séquençage de l'ADN à l'échelle de la population cartographie la façon dont les mutations somatiques influencent le vieillissement et le risque de cancer
Des chercheurs du Wellcome Sanger Institute ont développé une version améliorée du séquençage duplex NanoSeq, avec des taux d'erreur inférieurs à 5 erreurs par milliard de paires de bases, désormais compatible avec le séquençage exome entier et la capture ciblée. Appliquée à 1 042 échantillons d'épithélium oral et 371 échantillons sanguins issus d'une cohorte de jumeaux, cette méthode a détecté plus de 62 000 mutations conductrices réparties dans 46 gènes sous sélection positive dans le seul tissu oral. L'étude a également mis en évidence une sélection négative dans des gènes essentiels et produit des cartes de mutations à haute résolution comparables à la mutagenèse par saturation réalisée en laboratoire. Des modèles multivariés ont établi un lien entre l'âge, le tabac et l'alcool d'une part, et des modifications de l'acquisition de mutations somatiques ainsi que de la sélection clonale d'autre part, offrant ainsi la première fenêtre à l'échelle épidémiologique sur la carcinogenèse précoce et la contribution des mutations somatiques au vieillissement et aux maladies.
