Longevity & AgingUne nouvelle cartographie spatiale révèle l'emplacement des marques m6A de l'RNA au sein de tissus de souris intacts
L'ARN porte des marqueurs chimiques, et l'un des plus courants, la N6-méthyladénosine (m6A), contribue à réguler l'utilisation des gènes. Jusqu'à présent, les chercheurs parvenaient rarement à observer l'emplacement de la m6A au sein d'un tissu intact. Cette étude présente m6A-ARTR-DBiT, une méthode qui associe une détection de la m6A fondée sur la transcription inverse à un codage-barres spatial in situ dans le tissu, afin de cartographier la m6A à l'échelle du transcriptome tout en préservant l'architecture tissulaire. Les auteurs l'ont appliquée à des tissus embryonnaires de souris et à des cerveaux adultes, et ont observé des profils de m6A propres à chaque région, selon les domaines fonctionnels. Les niveaux de m6A étaient positivement corrélés à l'expression des enzymes « writers » de la m6A (méthyltransférases) et des protéines de liaison, ce qui a permis d'identifier une régulation épitranscriptomique spécifique de certaines régions tissulaires. Dans l'hippocampe, la méthode a permis de résoudre l'organisation de la m6A au sein de structures à très fine échelle. Ce travail constitue une avancée dans le développement d'outils chez la souris, et non une étude clinique, mais il ouvre la voie à l'étude des modifications de l'ARN dans le développement, le fonctionnement du cerveau et les maladies liées au vieillissement.
