Les parasites intestinaux associés à une plus grande diversité du microbiote intestinal dans les populations africaines

Une étude révolutionnaire menée au Gabon remet en question la vision conventionnelle des parasites et de la santé intestinale, en révélant que les helminthes transmis par le sol pourraient en réalité favoriser la diversité du microbiote. Des chercheurs du Max Planck Institute ont analysé des échantillons de selles provenant de 310 paires mère-enfant dans des communautés rurales et semi-urbaines, en utilisant à la fois des tests qPCR traditionnels et un séquençage métagénomique avancé pour détecter quatre grandes espèces de vers intestinaux.

Les résultats étaient saisissants : les infections parasitaires étaient nettement plus fréquentes en milieu rural à Ikobey (95 % des mères, 87,5 % des enfants) que dans la zone semi-urbaine de Lambaréné (19 % des mères, 2 % des enfants). Plus important encore, les individus présentant une plus grande richesse en espèces parasitaires affichaient une diversité bactérienne significativement plus élevée dans leur microbiote intestinal, avec les associations les plus marquées observées chez les enfants ruraux.

L'étude a validé la capacité du séquençage métagénomique à détecter avec précision les parasites, ouvrant de nouvelles perspectives pour l'analyse simultanée des parasites et du microbiote. Lorsque les chercheurs ont appliqué cette approche à cinq cohortes africaines supplémentaires, ils ont mis en évidence des schémas reproductibles reliant la présence de parasites à la diversité alpha du microbiote au sein de différentes populations.

Ces résultats suggèrent que les helminthes pourraient jouer un rôle dans la structuration d'écosystèmes intestinaux sains, un rôle jusqu'ici sous-estimé. Les parasites semblent créer des conditions favorables au développement de communautés microbiennes diversifiées, potentiellement par le biais d'une modulation immunitaire et d'une disponibilité nutritionnelle modifiée. Cela remet en cause la vision simpliste des parasites comme étant purement nuisibles et suggère l'existence de relations écologiques complexes au sein du microbiote intestinal humain.

Ces travaux ont des implications importantes pour la compréhension des disparités de santé mondiales et de l'hypothèse hygiéniste, selon laquelle la réduction de l'exposition microbienne dans les pays développés pourrait contribuer aux dysfonctionnements immunitaires et aux maladies chroniques.