Longevity & AgingNahezu vollständiger Katalog von Darmgenomen aus 41 Ländern verfeinert die Modellierung des mikrobiellen Stoffwechsels
Forschende haben HRGM2 entwickelt, eine erweiterte Ressource des Human Reference Gut Microbiome mit 155.211 nicht-redundanten, nahezu vollständigen Genomen aus 4.824 prokaryotischen Arten in 41 Ländern. Jedes Genom erfüllt strenge Qualitätskriterien (mindestens 90 % vollständig, höchstens 5 % kontaminiert). Das entspricht einem Zuwachs von 66 % bei den Genomen und von 50 % bei den Arten im Vergleich zum Katalog Unified Human Gastrointestinal Genome. Laut den Autoren verbessert die Ressource die DNA-basierte Artenprofilierung, hilft dabei, Unterschiede auf Stammebene aufzulösen, und unterstützt Untersuchungen von Antibiotikaresistenzgenen im Darm. Dass ausschließlich hochwertige Genome verwendet wurden, ermöglichte zudem automatisierte genomweite Stoffwechselmodelle ganzer Darmgemeinschaften, die nach Angaben der Autoren krankheitsassoziierte Stoffwechselinteraktionen zwischen Mikroben aufzeigen. Die Arbeit ist keine klinische Studie, sondern ein grundlegendes Werkzeug für die Mikrobiomforschung. Sie könnte aber künftige Forschung zu Darmgesundheit und Alterung zuverlässiger machen.
