Longevity & AgingFerramenta de IA DeepScence Mapeia Células Senescentes com Precisão Sem Precedentes
Pesquisadores da Duke University desenvolveram o DeepScence, uma ferramenta de aprendizado profundo não supervisionado construída sobre uma arquitetura de autoencoder, para detectar células senescentes em dados de sequenciamento de RNA de célula única e transcriptômica espacial. A equipe criou primeiro o CoreScence, um conjunto de genes curado com 39 genes consistentemente relatados em pelo menos cinco bancos de dados de genes de senescência publicados, abordando a enorme discordância entre os conjuntos de genes existentes. O DeepScence utiliza o CoreScence como entrada e aprende padrões complexos e não lineares de expressão gênica para pontuar células em um continuum de senescência. Testado em conjuntos de dados in vitro e in vivo de múltiplas plataformas, o DeepScence superou substancialmente os métodos de pontuação existentes e a ferramenta SenCID baseada em SVM supervisionado, alcançando AUROCs superiores a 0,9 em todos os conjuntos de dados e generalizando entre espécies, tecidos e contextos de indução de senescência.
