Longevity & AgingUn catálogo casi completo de genomas intestinales de 41 países afina la forma en que modelamos el metabolismo microbiano
Un equipo de investigadores creó HRGM2, un recurso ampliado del Human Reference Gut Microbiome que contiene 155.211 genomas casi completos y no redundantes, pertenecientes a 4.824 especies de procariotas de 41 países. Todos los genomas cumplen criterios estrictos de calidad (al menos un 90% de completitud y no más de un 5% de contaminación). Esto supone un aumento del 66% en el número de genomas y del 50% en el de especies respecto al catálogo Unified Human Gastrointestinal Genome.
Según los autores, el recurso mejora la caracterización de especies basada en DNA, ayuda a resolver diferencias a nivel de cepa y permite estudiar los genes de resistencia a los antibióticos en el intestino. Además, el uso exclusivo de genomas de alta calidad hizo posible construir de forma automatizada modelos metabólicos a escala genómica de comunidades intestinales completas, que, según los autores, revelan interacciones metabólicas entre microbios asociadas a enfermedades.
Se trata de una herramienta fundamental para la ciencia del microbioma, y no de un ensayo clínico, pero podría hacer más fiables las futuras investigaciones sobre la salud intestinal y el envejecimiento.
