Longevity & AgingLa herramienta de IA DeepScence mapea células senescentes con una precisión sin precedentes
Investigadores de la Universidad de Duke desarrollaron DeepScence, una herramienta de aprendizaje profundo no supervisado basada en una arquitectura de autocodificador, para detectar células senescentes en datos de secuenciación de RNA unicelular y transcriptómica espacial. El equipo creó primero CoreScence, un conjunto de genes curado compuesto por 39 genes reportados de forma consistente en al menos cinco bases de datos publicadas sobre genes de senescencia, con el fin de abordar la enorme discrepancia existente entre los conjuntos de genes disponibles. DeepScence utiliza CoreScence como entrada y aprende patrones complejos y no lineales de expresión génica para puntuar las células en un continuo de senescencia. Evaluado en conjuntos de datos in vitro e in vivo procedentes de múltiples plataformas, DeepScence superó ampliamente a los métodos de puntuación existentes y a la herramienta supervisada basada en SVM SenCID, alcanzando valores de AUROC superiores a 0,9 en todos los conjuntos de datos y mostrando capacidad de generalización entre especies, tejidos y contextos de inducción de senescencia.
